La tercera población lagunera que fundara el padre jesuita Juan Agustín de Espinoza, acompañado por el Capitán Antón Martín Zapata, fue la que en un principio fue conocida como “Santiago de Mapimí”, para tal efecto, se hicieron acompañar de un regular número de familias al parecer provenientes de Saltillo de origen español y tlaxcalteca, las que se dedicaban principalmente a las actividades agrícolas y de extracción de minerales, toda vez que en tal sitio existían grandes y valiosos yacimientos de toda clase de minerales.
El 25 de julio de 1598 el religioso Juan Agustín de Espinoza y quienes lo acompañaban, llegaron a territorio mapimeco, fundando tal día en que se celebraban las fiestas religiosas de Santiago Apóstol, el cual fue bautizado como “Santiago de Mapimí”, en honor al santo patrono de la nación española, señalándose en las crónicas de la época que tal nombre se le impuso en honor del santo patrono antes mencionado, mencionándose que tal día se celebró una misa en una capilla improvisada, precisamente en el lugar en donde actualmente se encuentra el templo de “Santiago Apóstol”.
Es de mencionarse que el vocablo Mapimí proviene de Mapeme que en dialecto cocoyome significa “cerro alto” tal y como era conocido por los originarios habitantes de la región. Las primeras minas que se descubrieron fueron las de “San Vicente, Jalapa y San Ignacio” en ellas se inició la gran industria extractora de la región, sobre todo de oro, plata y plomo lo que trajo como consecuencia el establecimiento de primitivas fundidoras. Desafortunadamente el progreso de Mapimí, siempre tuvo en contra las invasiones de los llamados indios bárbaros entre ellos los tobosos, cocoyomes y tarahumaras.
En el año de 1648 tuvo lugar la primera invasión de parte de los tobosos, lo que trajo como resultado una destrucción parcial, la segunda invasión fue de parte de los tarahumaras, pero la más conocida es la tercera la que tuvo lugar la tarde del jueves santo del año de 1715, en la cual intervinieron indios cocoyomes y tobosos, los cuales invadieron y arrasaron al incipiente poblado, al realizar una procesión litúrgica aproximadamente quinientas personas y al encontrarse reunidos en la plaza principal, privando de la vida a cien españoles y a más de trescientos criollos.
En tal ataque un grupo de mapimenses se llevó la imagen del cristo crucificado, la que fue depositada en la parroquia de Cuencamé, donde es venerado como “ El señor de Mapimí”. En el año de 1811 en una casona que aun se conserva fueron internados por varios días a su paso para Chihuahua a donde iban a ser procesados don Miguel Hidalgo y Costilla, don Ignacio Allende, Juan Aldama y Mariano Abasolo y en el año de 1864 don Benito Juárez García recibió la hospitalidad de los habitantes de la Villa de Mapimí, desde donde dictó trascendentales acuerdos para la comarca lagunera.
